Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
APOFQ13790 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.11
APOFQ13790 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
APOFQ13790 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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