Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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