Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
AP3B2Q13367 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
AP3B2Q13367 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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