Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms