Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABPB1Q06547 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AL031714.1-202ENST00000568106 3107 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABPB1Q06547 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms