Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACVR1Q04771 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms