Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATP7AQ04656 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP7AQ04656 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms