Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ERCC6Q03468 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms