Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PLOD1Q02809 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PLOD1Q02809 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms