Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
DEFA6Q01524 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DEFA6Q01524 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms