Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTBSQ01459 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTBSQ01459 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms