Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MS4A2Q01362 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms