Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRB1P82279 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRB1P82279 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRB1P82279 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRB1P82279 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRB1P82279 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRB1P82279 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRB1P82279 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRB1P82279 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRB1P82279 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms