Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PITX1P78337 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PITX1P78337 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms