Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms