Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASP4P49662 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms