Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FNTAP49354 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FNTAP49354 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms