Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC1A2P43004 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms