Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATP5C1P36542 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms