Protein–RNA interactions for Protein: P29350

PTPN6, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN6P29350 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN6P29350 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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