Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DUSP1P28562 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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