Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
VAMP1P23763 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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