Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TNNI3P19429 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms