Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPB42P16452 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPB42P16452 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EPB42P16452 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EPB42P16452 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms