Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
F5P12259 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
F5P12259 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
F5P12259 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
F5P12259 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
F5P12259 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
F5P12259 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
F5P12259 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
F5P12259 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
F5P12259 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms