Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CDK4P11802 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms