Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC175P0C221 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms