Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGAVP06756 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms