Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFNB1P01574 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms