Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LTAP01374 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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