Protein–RNA interactions for Protein: O75969

AKAP3, A-kinase anchor protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP3O75969 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AKAP3O75969 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AKAP3O75969 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms