Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TULP3O75386 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TULP3O75386 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TULP3O75386 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms