Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SLC25A20O43772 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms