Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNMO15061 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNMO15061 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNMO15061 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNMO15061 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNMO15061 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNMO15061 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNMO15061 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNMO15061 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNMO15061 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms