Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TXNDC9O14530 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms