Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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USP9YO00507 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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USP9YO00507 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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USP9YO00507 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
USP9YO00507 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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