Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms