Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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USP17L12C9JPN9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP17L12C9JPN9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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