Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
E2F8A0AVK6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F8A0AVK6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms