Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD54BQ9Y620 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms