Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CCL27Q9Y4X3 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms