Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NCKAP1Q9Y2A7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms