Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms