Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms