Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLXNB3Q9ULL4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms