Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
POLKQ9UBT6 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms