Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PPARGC1AQ9UBK2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms