Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
USP36Q9P275 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
USP36Q9P275 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms