Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM9Q9P0T7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.5 ms