Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms